重庆交通大学研究生院是一所综合性研究生院，下设授权硕士、博士学位授权单位以及博士后流动站。研究生院以“厚德博学，坚定自信”为校训，秉持“民航铸就梦想，铁路成就未来”的办学理念，为学生提供良好的学习和研究环境，为国家培养高素质的创新型、应用型人才。
研究生院下设21个研究方向，涵盖工、管、文、法、理、教育、艺术等诸多学科。研究生院拥有一支高水平的师资队伍，有国家杰出青年科学基金获得者、长江学者、千人计划、教育部“新世纪人才支持计划”等省部级以上各类人才98人。目前，共有硕士生2536人、博士生273人在研究生院学习研究。
研究生院拥有良好的学习生活环境，学生公寓、食堂、图书馆、体育设施、医疗设备等一应俱全。研究生院还积极推行国际化办学，与境外高校建立了广泛的合作关系，为研究生出国交流提供了广阔的平台。
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